Świat Naruto podzielony jest tak jak nasz w czasie rzeczywistym na różne kraje. Lecz te narody biorą nazwy od charakterystycznych rzeczy, które występują na ich terenie np. Kraj Liścia wziął nazwę od dużej ilości lasów liściastych występujących na ich terenie. Potężniejsze narody posiadają wioskę lub kilka wiosek Shinobi (Gakure). Osady te stanowią podstawę militarną danego kraju. Każda wioska jest jednak uzależniona w pewien sposób od głowy państwa. Niemal każda osada posiada swojego Kage, który jest stróżem wioski i ma on obowiązek, jeżeli jest taka konieczność, oddać za nią życie. Kage to najważniejsza osoba w wiosce. Każda gakure ma w swoich szeregach Radę Starszych składającą się z dwóch osób, które wybierają nowego Kage oraz rządzą osadą podczas jego nieobecności (np. kiedy jest na polu bitwy). W świecie Shinobi wyróżniamy 5 głównych wiosek, które posiadają Kage:

Konoha-Gakure (Wioska Ukrytego Liścia)

Jedyna osada w Kraju Liścia co ma korzystny wpływ na jej rozwój, ponieważ nie ma konkurencji i wszystkie dochody z misji spływają właśnie na nią. Wioskę tą założył Shodaime (1st Hokage) wraz z Uchiha Madarą. Ten pierwszy został Hokage, a drugi założył posterunek Konohy, który dbałby o bezpieczeństwo w wiosce. Jej żywiołem jest ogień. Właśnie Katon jest tu podstawowym rodzajem NinJutsu. Kage przyjmuje tu przedrostek „Ho” (ogień) co daje nam Hokage, czyli Cień Ognia. Wioska ta położona jest w centrum ogromnego lasu liściastego. Nie różni się wyglądem od zwykłych miast. Całą osadę otacza potężny kamienny mur. Konoha nie ma problemów finansowych i osiągnęła dominację nad innymi Gakure dzięki ciężkiej pracy. Pierwszemu udało się stworzyć właśnie takie społeczeństwo, które stało się jedną wielką rodziną. Po walce Madary z Shodaime posterunek przetrwał nadal, zaś pierwszy mianował swojego zastępcę: Nidaime. 1st i 2nd wzięli pod swoje skrzydła Sarutobiego i mianowali go Trzecim Hokage. Był to właśnie okres, kiedy Konoha miała w swoich szeregach trzech żyjących Hokage. Sandaime przerastał w umiejętnościach swoich poprzedników, ale jeszcze silniejszy był od niego Minato Namikaze, którego Sarutobi mianował na 4th Hokage. 13 lat przed rozpoczęciem akcji w Naruto wioskę nawiedził najpotężniejszy z Bijuu: Kyubi. Wówczas zginęło wielu utalentowanych Shinobi z tej osady. Lecz Yondaime uratował wioskę pieczętując demona w swoim synu: Naruto. Wtedy znów na stanowisko Hokage powrócił Sandaime. Wioska prowadziła później wojnę z Krajem Obłoków, czyli aż dwiema Gakure: Wioską Ukrytego Deszczu i Wioską Ukrytego Obłoku. Zawarto pakt pokojowy za sprawą klanu Hyuuga. Lecz podczas wojny Konoha cały czas miała przewagę. Po śmierci Sarutobiego mianowany został nowy Hokage, a mianowicie kobieta: Tsunade. Godaime sprawuje rządy nadal. Lecz wcześniej miała miejsce bitwa Konohy z Wioską Piasku i Wioską Dźwięku. Właśnie podczas tego wydarzenia zginął Czwarty Kazekage i Sandaime. Po wszystkim Konoha zawarła stały sojusz z Suną-Gakure.
Wioska Ukrytego Liścia to najpotężniejsza i największa osada Shinobi w świecie Naruto. Wypuściła na świat wielu potężnych Ninja takich jak Jirayia, Tsunade, Minato Namikaze, Uchiha Itachi, Orochimaru, Hatake Kakashi, Sarutobi Asuma, Yuushi Kurenai, Maito Gai czy też sam Uzumaki Naruto. W jej obrębie powstało również kilka potężnych klanów, m.in. Hyuuga czy Uchiha. Jest to też główna wioska, w której dzieje się akcja Naruto.

Suna-Gakure (Wioska Ukrytego Piasku)

Wioska położona w Kraju Wiatru. Po tym jak Konoha osiągnęła dominację wioska ta ma stale problemy finansowe. Lecz Suna-Gakure cechuje się tym, że stawia na jakość, a nie ilość. Tzn, że mają mniej Shinobi, lecz każdy jest bardzo utalentowany. Wokół wioski trwają stale burze piaskowe, zaś samą osadę otacza ogromny mur z twardego piasku, a domy są okrągłe w kolorze właśnie tego kruszcu. To uniemożliwia odszukanie wioski przez zwykłego podróżnika czy szpiega. Kage nosi przedrostek „Kaze” (wiatr), co daje Kazekage, czyli Cień Wiatru. Suna-Gakure tak jak Konoha miała dotychczas pięciu Kage. O Pierwszym i Drugim nic nie wiadomo. O Trzecim wiemy tylko tyle, że był niezwykle potężny i że mianuje go się najpotężniejszym Kage Piasku w historii. Czwarty to ojciec Gaary, Temari i Kankuro, zaś Piątym jest sam Gaara. Wioska Piasku została bezczelnie wykorzystana przez Orochimaru, który zabił Czwartego Kazekage, podszył się pod niego i powiedział, że zawarli sojusz z Wioską Dźwięku. Następnie razem z Oto-Gakure Piasek zaatakował Konohę i poniósł klęskę. Jednak gdy dowiedziano się o zdradzie Orochimaru Suna-Gakure zawarła sojusz z Wioską Liścia. Tak jak z Konohą związany jest Kyubi, tak z Suną związany jest Shukaku, którego Czwarty Kazekage zapieczętował w Gaarze. Tak czyniąc zapewnił okrutny los dla swojego syna. Ogólnie ta wioska jest zgraną populacją i ma dużą siłę militarną. Jak dotąd nadal utrzymuje stały sojusz z Wioską Ukrytego Liścia. Żywiołem osady jest wiatr, dlatego Shinobi Suny specjalizują się w NinJutsu pokroju Fuuton.

Kiri-Gakure (Wioska Ukrytej Mgły)

Niegdyś potęga militarna wśród Gakure. Niestety zmieniło się to po buncie klanu Kaguya. Wioska jest ulokowana gdzieś w Kraju Obłoków, lecz nie prowadziła ona wojny z Konohą tak jak Wioska Deszczu i Wioska Obłoków. W ogóle niewiele o niej wiadomo. Osadę położona jest w dużej dolinie i cały czas spowija ją mgła. Kage dostaje tu przedrostek „Mizu” (woda), co daje Mizukage, czyli Cień Wody. Nic nie wiadomo na temat obecnego Mizukage, ani o poprzednich. Poznaliśmy jak dotąd 6 członków tej wioski: Momochi Zabuza, Haku, Hoshigaki Kisame, Kurosuki Raiga i Demoniczni Bracia. Ninja tej osady słyną z zaciętości oraz wysokich umiejętności. Wioska praktykowała kiedyś w Akademii egzamin końcowy, który polegał na tym, aby zabić przyjaciela ze szkolnej ławki w walce na śmierć i życie. Zostało to zaniechane po tym jak Momochi Zabuza wybił wszystkich uczestników egzaminu. W wiosce powstała organizacja: Siedmiu Mistrzów Miecza z Kiri-Gakure, która zrzeszała siedmiu najpotężniejszych Ninja osady. Należeli do niej m.in. Kisame, Zabuza i Raiga. Organizacja ów była jednostką elitarną w wiosce. Niestety rozpadła się z niewiadomych powodów. Żywiołem wioski jest woda, dlatego Shinobi specjalizują się w rodzaju NinJutsu: Suiton. Ogólnie, bardzo tajemnicza wioska.

Kumo-Gakure (Wioska Ukrytego Obłoku)

Najpotężniejsza i największa wioska ulokowana w Kraju Obłoku. Niezwykle potężna i mająca w swoich szeregach wielu Shinobi. Sąsiaduje z Wioską Ukrytą w Deszczu, zaciągnęła też z niej wielu utalentowanych Ninja. Kage tej wioski przyjmuje przedrostek „Rai” (błyskawica), co daje Raikage, czyli Cień Błyskawicy. Nic nie wiadomo na temat obecnego Raikage, ani o poprzednich. Wioska ta toczyła wojnę z Konohą, lecz cały czas przewagę miała Wioska Liścia. W końcu próbowano zakończyć wojnę paktem. Aby go podpisać wysłano jednego z najsilniejszych Shinobi. Lecz miał on za zadanie ukraść Hyuuge Hinatę. Obłok bowiem chciał zdobyć sekret Byakugana. Nie udał mu się taki występek, ponieważ został zabity przez ojca Hinaty: Hyuuge Hiashiego. Po tym władze postanowiły obarczyć Hiashiego o morderstwo i zażądać jego ekstradycji. Konoha nie miała wyjścia, lecz postanowiono oddać Hizashiego, brata bliźniaka należącego do gałęzi klanu Hyuuga. W ten sposób Kumo-Gakure dostało to czego chciało a klan obronił sekret swojego Kekkei Genkai. Żywiołem wioski są błyskawice, dlatego Shinobi specjalizują się w NinJutsu rodzaju Raiton.

Iwa-Gakure (Wioska Ukrytej Skały)

Bardzo mało wiadomo na jej temat. Jej żywiołem jest ziemia, dlatego Shinobi specjalizują się tam w NinJutsu pokroju Doton. Kage tej wioski dostaje przedrostek „Tsuchi” (ziemia), co daje Tsuchikage, czyli Cień Ziemi. Ninja tej wioski ukazani są tylko w fillerach, w pierwszej serii Naruto, podczas misji, w której brali udział Kakashi, Naruto, Neji i TenTen. Można o nich powiedzieć, że są bardzo silni i przebiegli. Osada znajduje się gdzieś w Kraju Ziemi, można przypuszczać, że jej społeczeństwo żyje w odizolowaniu od świata. Jeszcze jednym przedstawicielem tej wioski jest już nieżyjący członek Akatsuki Deidara.

Są też wioski, które nie mają Kage:

Oto-Gakure (Wioska Ukrytego Dźwięku)

Wioska położona w Kraju Dźwięku. Zarówno osada, jak i kraj zostały stworzone i są pod władzą Orochimaru. Jest to nietypowa wioska, ponieważ nie składa się z mieszkańców pochodzących z tych terenów, lecz najczęściej z mising-ninów innych wiosek, którzy są starannie selekcjonowani przez Orochimaru. Nie istnieje tu coś takiego jak Akademia Ninja, Shinobi od razu zostaje Geninem, a nawet jak zechce Sannin Chuuninem czy Jouninem. Głównym celem wioski jest zagłada Konohy, a następnie stopniowe poszerzanie swojej władzy na całym świecie. Ninja do walki posługują się dźwiękiem i falami dźwiękowymi. Tutaj udał się właśnie Sasuke po walce z Naruto

Ame-Gakure (Wioska Ukrytego Deszczu)

Kolejna wioska znajdująca się w Kraju Obłoków. Jest ściśle związana sojuszem z Kumo-Gakure. Nie posiada Kage i jest raczej mało znaczącą osadą w świecie Shinobi. Wielu jej wojowników przechodzi do Wioski Ukrytego Obłoku, gdzie są rekrutowani. Ninja Deszczu spotykamy podczas Egzaminu Selekcji Chuunin. Doszli do 2 etapu, ale tam zostali zabici przez Gaarę. Innym jest płatny morderca, który chciał unieszkodliwić Morino Idate podczas jego wyścigu. Wygrał walkę z Sasuke, lecz po tym przegrał z Naruto. Wojownicy Deszczu posługują się technikami związanymi z atakowaniem przeciwnika z góry np. za pomocą parasoli, które wyrzucone w górę wypuszczają z siebie masę Shurikenów, Kunai czy Senbon.

Kusa-Gakure (Wioska Ukrytej Trawy)

Wioska położona gdzieś w Kraju Trawy. Nic o niej nie wiadomo oprócz kilku małych szczegółów. Osada jest bowiem bardzo rozległa, i znajduje się na niej wiele jezior, łąk i lasów. Przypuszcza się, że jest niezależna. Nie posiada również Kage. Położony jest też w niej Most Nieba i Ziemi. Z jej przedstawicielami możemy się spotkać podczas Egzaminu Selekcji Chuunin, lecz zostają oni szybko zabici przez Orochimaru. Jedynym jak dotąd znanym nam i żyjącym członkiem tej wioski jest Zetsu, który cechuje się niezwykłymi właściwościami i należy do Akatsuki.

Taki-Gakure (Wioska Ukrytego Wodospadu)

Nie wiadomo dokładnie w jakim kraju leży wioska, ale położona jest ona na klifie wielkiego wodospadu. Nie liczy się ona zbytnio w świecie Shinobi, ani nie posiada Kage. Wejście jest dobrze chronione, a cała osada leży u stóp ogromnego drzewa, co daje jej ochronę przed szpiegami lub niechcianymi obserwatorami. Takim nieoficjalnym władcą wioski jest Shibuki. Wioska słynie też z Bohaterskiej Wody, po której wypiciu Shinobi staje się o wiele silniejszy i szybszy. Jest to ostateczna broń osady, ale zarazem bardzo dobrze strzeżona.

Yuki-Gakure (Wioska Ukrytego Śniegu)

Wioska ukazana w pierwszym filmie kinowym Naruto. Nie wiadomo, w jakim kraju jest ulokowana, ale jest położona gdzieś w wiecznie ośnieżonych, wysokich szczytach górskich. Ninja tej wioski posługują się skomplikowanymi urządzeniami mechanicznymi, za pomocą których wygrywają zazwyczaj walki. Nie są zbyt utalentowani. Ogólnie nic więcej nie wiadomo na temat tej osady.