Klan Uchiha jak się domyślacie ma owianą tajemnicą historię, która wydaje się być tragiczna, jednak znajomość jej jest niezbędna do zrozumienia jakichkolwiek kroków przedstawiciela tego klanu – Itachiego. Zauważmy, że Sasuke nie zna tej legendy, co również skutkuje na jego myśleniu. Jak zapewne wiecie klan Uchiha jest odłamem klanu Hyuuga, najpotężniejszego rodu w Konoha-Gakure, który posiada swą niezwykłą moc klanową, jaką jest Byakugan. Wiele lat temu jedna z córek Hyuuga zakochała się w mężczyźnie z poza wioski – Sojobo, który był królem Tengu. On jak każdy miał swoje tajemnice, jednak jego były mroczniejsze niż innych, mianowicie był on demonem, jednak córka klanu Hyuuga nie była tego świadoma, gdyż znała go wyłącznie jako człowieka. Dziewczyna wyszła za Sojobo mimo sprzeciwów klanu.Zakochani rychło wzięli ślub i jakiś czas po małżeństwie urodziło im się dziecko, które Sojobo nazwał Madara *Uchiha. Madara wyrósł na potężnego shinobi, a dzięki temu, iż w jego żyłach płynęła krew Tengu, a po matce odziedziczył więzy krwi Hyuuga, ukształtowało się nowe, potężne DouJutsu, jakim jest Sharingan. Dzięki Sojobo, Madara potrafił teleportować się na niewielką odległość oraz telepatycznie wkradał się do umysłów ludzi. Udało mu się również aktywować Mangekyo Sharingan. Wraz z swoim przyjacielem Shodaime założył pierwszy posterunek w Konoha, oraz obiecał bronić wioski i prawa za wszelką cenę.

Jednak, gdy wiek Madary sięgnął dorosłości, Sojobo chciał urzeczywistnić swój plan, który polegał na stworzeniu a następnie przejęciu idealnego męskiego ciała, którym był jego syn. Madarze oczywiście ta wersja nie przypadła do gustu, był wściekły na ojca. W wiosce był kimś szanowanym i nie miał zamiaru tego tracić oddając swe ciało jako pojemnik na duszę. Nie odda ciała, chyba, że po przegranej walce z królem Tengu. Zdawał sobie sprawę, że nie pokona go sam, postanowił zwrócić się o pomoc **Bijuu-Kyuubi. Ten zgodził się na takie rozwiązanie i udostępnił potomkowi demona władanie nad jego czakrą i umiejętnościami. Jednak nawet z mocą Kyuubi, Madara nie zdołał pokonać swojego ojca. Zapieczętował go. Pieczęć ta była wyjątkowa, gdyż by ją złamać potrzeba trzech użytkowników Sharingan Mangekyo, Sharingan z klanu Uchiha oraz mocy Kyuubi’ego. Madara był pewny, że to wystarczy by Sojobo nigdy nie doszedł do władzy. Gdy Shodaime dowiedział się o sekretnym pakcie Madary z Kyuubi’m był zły – wywiązała się między nimi walka, która ostatecznie wygrał Shodaime.

Lata później przychodzi na świat dziecko klanu Uchiha. Z wyjątkowymi zdolnościami szybko wspina się na szczeble rang ninja. Gdy został liderem ANBU ojciec uznał, że nadszedł czas by zapoznać z syna z historią klanu. Itachi dowiedziawszy się o wszystkim zaczął roić w swojej głowie makabryczny plan.Pewnej nocy zaczął wprowadzać plan w życie. Zwabił swojego przyjaciela Shisui’ego nad rzekę Nakano i zabił go z zimną krwią fałszując list pożegnalny, który miał świadczyć o samobójstwie przyjaciela. Tej nocy Itachi aktywował Mangekyo Sharingan.

Itachi nie widząc przyszłości dla swojego klanu, w nocy przy pełni księżyca wybił cały klan zostawiając przy życiu tylko jednego Uchihe. Do wypełnienia planu potrzebował właśnie Sasuke, którego nie zabił nie bez powodu. Młodszy brat miał być tym trzecim posiadaczem Sharingana, dzięki czemu uda mu się wyzwolić z pieczęci Sojobo. Użył Tsukiyomi, by dokładnie wyryć w jego umyśle obrazy z tamtego dnia, krwawego mordu klanu Uchiha. Sasuke ma nienawidzić brata tak bardzo, tak bardzo ma chcieć być silniejszym, że nie oprze się mocy Mangekyo Sharingan, którego zapragnie.